Museo Avellonia

Een digitaal archief van een Lepidoptera-specimencollectie voor onderzoekers en het publiek, met IIIF-afbeeldingen en de workflow van een conservator voor het digitaliseren van specimendozen.

 

## De cliënt

Museo Avellonia is de online thuisbasis van de privécollectie Lepidoptera (vlinders en motten) van Göran Sjöberg, bewaard in Villa Avellonia: een gestructureerd archief van de exemplaren, gebouwd voor onderzoekers en het publiek. Prof. Markus Franzén gaf opdracht voor de site, die naast twee zustersites staat die voor hem zijn gebouwd, het [Quercus Project](/nl/projecten/quercus-project) en [Biodiversa](/nl/projecten/biodiversa).

Het publiek bestaat uit deskundige onderzoekers en geïnteresseerde leden van het algemene publiek die een exemplaar en de bijbehorende taxonomie willen opzoeken. De site moet op twee manieren tegelijk werken: een openbaar naslagwerk dat duidelijk leesbaar is voor een bezoeker zonder opleiding, en een werkbank voor de conservator om een foto van een exemplaardoos om te zetten in gestructureerde, doorzoekbare records.



 

 





 

## Een specimenbox digitaliseren

Een specimenbox kan tientallen afzonderlijk vastgepinde specimens bevatten, elk met een eigen gedrukt label. Het dashboard van de curator importeert een foto van elke box uit een gedeelde Google Drive-map en laat die door een computervisiemodel lopen, het Segment Anything Model (SAM), dat voor elk specimen dat het vindt een regio voorstelt. De curator bevestigt, past aan of tekent een regio opnieuw, en voegt degene toe die het model heeft gemist, in plaats van elke regio vanaf nul te tekenen.

Die regio's worden opgeslagen in drie geneste, op percentages gebaseerde coördinatenruimten in plaats van pixelcoördinaten: de positie van een specimen binnen de box, de positie van een label binnen het specimen, en de positie van een uitsnede binnen het label. Omdat geen van de drie aan een vast pixelraster is gebonden, lijnt dezelfde regio nog steeds correct uit wanneer de onderliggende afbeelding op een andere grootte wordt aangeboden, van een volledige deepzoomweergave tot een miniatuur.



Filmbestand

  

 

 



 

 

 





 

## In één oogopslag

OpdrachtgeverProf. Markus Franzén, voor de collectie van Göran Sjöberg in Villa AvelloniaCollectieLepidoptera-exemplaren (vlinders en motten), hun taxonomie, vindplaatsen en bijbehorende mediaPlatformDrupal 11Site[museo.avellonia.se](https://museo.avellonia.se)StatusGebouwd; de verhuizing naar het eigen domein van de collectie moet nog plaatsvindenMADDev-producten[Species External Entity](/nl/producten/species-ext), [External Entities](/nl/producten/external-entities)

 

 





 

## Wat we hebben gebouwd

- Een gestructureerd inhoudsmodel voor specimens, hun taxonomie, verzamellocaties en bijbehorende media
- Dezelfde soortenverrijking als de Quercus Project- en Biodiversa-sites, uit Catalogue of Life, GBIF, iNaturalist, de IUCN Red List en Wikipedia
- Diepzoomweergave van afbeeldingen van specimenboxen, zodat een bezoeker van een hele box naar het detail van één specimen kan inzoomen zonder één te grote afbeelding te laden
- Een zijpaneel dat de gegevens van een specimen toont naast de afbeelding waar het bij hoort
- Een Darwin Core Archive-export, het standaarduitwisselingsformaat voor biodiversiteitsgegevens, dat ook beschermt tegen dubbele soortrecords



 

 





 

## Waardplantgegevens

Lepidoptera-taxonomietermen op de site bevatten waardplantgegevens: waarvan bekend is dat de rups van die soort zich ermee voedt. De meest directe route zou hergebruik van een brede interactiedatabase die al in de site is geïntegreerd, met relaties tussen veel taxa, mogelijk hebben gemaakt. We hebben daar niet voor gekozen: de aggregatie in die database laat stilzwijgend de per-recordweging vallen die wordt gebruikt om het belang van een waardplant te rangschikken, samen met twee kolommen, over schade en over hoe en waar een exemplaar werd gekweekt, die alleen de eigen HOSTS-dataset van het Natural History Museum vastlegt.

Daarom bevraagt de site HOSTS rechtstreeks en valt automatisch terug op de bredere database voor taxa, meestal tropische en Indo-Pacifische soorten, die HOSTS niet dekt. Resultaten verschijnen via dezelfde weergave van verwante soorten die elders op de site wordt gebruikt.



 

 





## Start een project.

Vertel ons over uw collectie en wat het archief ervan moet doen.



[Neem contact op →](/nl/contact)